Outre son appartenance au PNR, l’étang de Lers est classé comme "zone d’intérêt communautaire au titre de la directive européenne habitat ". Autrement dit, les tourbières et zones humides qui le composent sont protégées à une échelle européenne.Pour préserver cette biodiversité, le syndicat intercommunal et la commission syndicale Massat-Le Port mettent en place diverses animations de sensibilisation. "Nous avons une animation annuelle avec la fédération pastorale, nous organisons des journées avec les enfants, et nous avons bien sûr des présentations annuelles d’experts naturalistes qui travaillent sur le site", indique Noëlle Moralès, membre du syndicat. Autant d’actions qui aident à sensibiliser le public aux écosystèmes propres à l’étang. Le travail avec les bergers participe aussi de cette préservation. "Nous avons mis en place des contrats contractuels avec les trois groupements pastoraux alentours, précise Noëlle Moralès. En échange d’une contrepartie financière, les bergers font pâturer les troupeaux sur certaines zones. Ça permet de nettoyer certains habitats qui ne devraient pas se reformer. Avec cette pratique ancestrale, ils concilient activité humaine et préservation de l’environnement."